لم تقتصر أزمة الإخوان وما تشهده الجماعة من انقسام داخلى فى مصر فقط، لكن وصلت إلى مدينة كردفان وسط السودان، ففى الوقت الذى يتواجد فيه قيادتين للجماعة فى مصر متمثلة فى محمود عزت القائم بأعمال المرشد..
انقلب إخوان السودان، على المراقب العام بالخرطوم ، وأطاحوا به بعد إجراءاته بتعطيل المؤتمر العام للجماعة بالسودان
وقع انشقاق جديد فى جماعة الإخوان المسلمين فى السودان، حيث أطاح اجتماع طارئ لمجلس شورى الجماعة بمراقبها العام على جاويش، وعدد من القيادات، عقب حزمة قرارات أصدرها الأخير