علق الدكتور على جمعة، مفتى الجمهورية السابق، بشأن ما قاله يوسف زيدان أنه لا وجود للمعراج، قائلاً:" إن أرقام السور القرآنية ليس لها علاقة بنزولها، بل لها علاقة بتمام السورة، لأنه يمكن وجود سور نزل منها آيات ولم تنتهى".
قال الدكتور على جمعة، مفتى الجمهورية السابق، إنه ليس صحيح أن كلمة القدس كلمة عبرية كما يقول يوسف زيدان بل هى عربية وتعنى الطهر والنزاهة والطيبة والعلو وغيرها، وتابع:"ابن حجر العسقلانى أورد 20 لفظة لكلمة القدس".<br>
قال الدكتور على جمعة، مفتى الجمهورية السابق، إن الإجماع الدينى يقول بزيارة المسجد الأقصى وهو تحت الإحتلال وأنه من القربات.
قال الدكتور على جمعة، مفتى الجمهورية السابق، إن الدين الإسلامى دعا للتدبر والتفكير ولم يقل بتحريمه مطلقاً ويؤكد على إنطلاق الفكر وحريته وحرية العلم بلا قيد.
قال الدكتور على جمعة، مفتى الجمهورية السابق، إن المسلمين اقاموا حضارتهم على ثلاث أشياء أولها اللغة العربية كونها محور حضارتهم.
اعتبر الدكتور على جمعة، مفتى الجمهورية السابق، رعب الغرب من عودة الديناصورات أو حدوث غزو فضائى أو تفشى الأمراض الوبائية القاتلة مثل الإيدز والإيبولا.