في عام 540 قبل الميلاد، غزت بلاد فارس مدن إيونيا (ساحل بحر إيجه في آسيا الصغرى) وبعد ذلك حكمها طغاة محليون رشحهم الامبراطور الفارسي في ساردس وفي عام 499 قبل الميلاد أطلق أريستاجوراس، التابع اليوناني لميليتوس، رحلة استكشافية مشتركة إلى جانب المرزبان الفارسي أرتافيرنيس لغزو جزيرة ناكسوس اليونانية في محاولة لتعزيز موقفه.
كانت المهمة فاشلة تمامًا، ومع شعوره بإزاحته الوشيكة من منصبه كطاغية، اختار أريستاجوراس تحريض إيونيا بأكملها على التمرد ضد الملك الفارسي، داريوس الكبير.
في محاولة يائسة لإنقاذ نفسه، اختار أريستاجوراس تحريض رعاياه، على الثورة ضد الفرس، وبذلك بدأ ما يسمى بثورة ميليتوس وفقا لموقع جريك ريبورتر.
كانت هذه بداية الثورة الأيونية، والثورات المرتبطة بها في أيوليس ودوريس وقبرص وكاريا، وهي الانتفاضة الكبرى للعديد من المناطق والمدن اليونانية في آسيا الصغرى ضد الحكم الفارسي والتي استمرت من 499 قبل الميلاد إلى 493 قبل الميلاد.
سقطت المدن اليونانية الأيونية وإيوليا على ساحل آسيا الصغرى في أيدي الفرس في أعقاب الغزو الفارسي لليديا (547 إلى 546 قبل الميلاد).
عبر الفرس لأول مرة إلى أوروبا في حوالي عام 513 قبل الميلاد عندما أطلق داريوس حملة فاشلة إلى حد ما ضد البدو السكيثيين شمال نهر الدانوب. وأعقب ذلك غزو أجزاء من تراقيا عام 512 قبل الميلاد، مما أعطى الفرس موطئ قدم في أوروبا، وهدد طرق تجارة الحبوب اليونانية إلى البحر الأسود.
كان الهدف التالي الواضح للهجوم الفارسي هو مدن البر الرئيسي لليونان، لكن الثورة الأيونية جاءت أولاً وأعطت الفرس سببًا مقنعًا لغزوهم.
كان في قلب التمرد استياء المدن اليونانية في آسيا الصغرى من الطغاة الذين عينتهم بلاد فارس لحكمهم، إلى جانب التصرفات الفردية لاثنين من الطغاة الميليسيين، هيستياوس وأريستاجوراس.
